The Crows Zero 2 ภาคแรกได้จบสิ้นไปนานหลายเดือนแล้ว เกนจิ (ชุน โอกุริ) และกลุ่มจีพีเอสที่เป็นฝ่ายมีชัย กลับต้องเผชิญกับความท้าทายอีกครั้งจากนักเรียนของสถาบันโฮเซนอคาเดมี ที่ได้สมญานามจากทุกคนว่า  กองทัพนักฆ่า  อันที่จริงแล้ว โรงเรียนทั้งสองแห่งมีประวัติการขัดแย้ง และต่อสู้กันมาก่อน และความเกลียดชังก็เริ่มปะทุขึ้นอีกครั้ง ทำลายความสงบที่ทั้งสองฝ่ายเคยมีมาจนถึงปัจจุบัน ภายใต้การนำของ นารุมิ ไทกะ (โนบูอากิ คาเนโกะ) ผู้นำคนใหม่ของโฮเซนอคาเดมี เขาเตรียมพร้อมที่จะเปิดแผลเก่าด้วยการเข้าโจมตีโรงเรียนซูซึรันไฮสกูลทุกรูปแบบ